亞飛特感覺(jué)它的身上少了一塊，特意去找克萊爾看病，而這時(shí)柏圖斯因?yàn)橄涣紒?lái)找克萊爾?？巳R爾非常奇怪亞飛特會(huì)知道它的身體少了一塊，而柏圖斯如鐵一般的胃竟會(huì)消化不良，結(jié)果一查才知道柏圖斯胃里消化不了的東西，便是亞飛特缺失的那一塊。問(wèn)題查清楚了，亞飛特不得不提出，讓它進(jìn)入柏圖斯的身體里，把一塊東西拿出來(lái)。柏圖斯不愿意讓亞飛特進(jìn)入他的身體，在克萊爾的勸說(shuō)下，柏圖斯才勉強(qiáng)張口讓亞飛特把東西取出來(lái)。凱莉針對(duì)戈登和約翰惡作劇亞飛特的事情，對(duì)他們進(jìn)行了批評(píng)，結(jié)果無(wú)意得知約翰是除了艾薩克之外，奧維爾號(hào)最聰明的人。凱莉因?yàn)榧s翰的聰明，打算跟艾德商量，讓約翰主管一個(gè)部門，可艾德卻認(rèn)為約翰和戈登一起戲弄亞飛特這件事情，足以顯示出他不適合當(dāng)一個(gè)領(lǐng)導(dǎo)，所以他不同意凱莉的提議。正當(dāng)艾德和凱莉各執(zhí)己見(jiàn)爭(zhēng)吵之際，奧維爾號(hào)突然劇烈晃動(dòng)了一下，他們只能先去控制室查看問(wèn)題。在調(diào)查碰撞問(wèn)題之時(shí)，凱莉提議讓約翰陪同艾薩克一起去分析數(shù)據(jù)，讓約翰非常的吃驚，但他還是服從命令。艾薩克和約翰去調(diào)查了一下，發(fā)現(xiàn)有不明物體導(dǎo)致他們的植物枯萎，而導(dǎo)致這個(gè)結(jié)果的原因還未查清楚。凱莉針對(duì)這個(gè)難題，再次跟艾德提給約翰升職的事情，結(jié)果艾德還是反對(duì)凱莉的說(shuō)法，并想升亞飛特主管此事。凱莉?yàn)榱私o約翰爭(zhēng)取機(jī)會(huì)，用大副的身份要求艾德，讓約翰組成一個(gè)分析小組，來(lái)考一下約翰是否真如檔案所記錄的那樣聰明。艾德答應(yīng)了凱莉，突然意識(shí)到自己的艦長(zhǎng)一職與凱莉有關(guān)，于是問(wèn)了將軍的事情，結(jié)果被他問(wèn)出，他的艦長(zhǎng)之位是因?yàn)閯P莉才得到的。艾德覺(jué)得約翰并沒(méi)有凱莉說(shuō)的那樣有野心，凱莉于是把約翰叫來(lái)談話，結(jié)果約翰果真表示，他對(duì)自己的現(xiàn)狀很滿足，并不想要求更多。一艘小型艦在奧維爾號(hào)附近，如若再不改變航線就有可能撞上太空異物，所以艾德要求聯(lián)線霍巴拉克走私艦，勸說(shuō)艦長(zhǎng)布拉瓦洛赫改變航線，可他并沒(méi)有接受提意，最后直接撞上去了。布拉瓦洛赫身亡，走私艦上留下了20箱奎爾等離子步槍，這給奧維爾號(hào)帶來(lái)了麻煩，很可能會(huì)惹來(lái)失槍人的追殺。凱莉找艾德談話，艾德一直躲著凱莉，在凱莉堅(jiān)持要找他談話之時(shí)，他才表示凱莉的做法，讓他現(xiàn)在懷疑自己做的那些決定是否正確。亞飛特因?yàn)榘律思s翰當(dāng)科學(xué)組的頭，而不是它而生氣地找艾德質(zhì)問(wèn)，甚至于罵艾德是種族歧視，才會(huì)沒(méi)有選它而選約翰。約翰到了科學(xué)組報(bào)到，可他從沒(méi)當(dāng)過(guò)領(lǐng)導(dǎo)，不知道要如何發(fā)號(hào)施令，所以一直在門口徘徊，直到遇上戈登，他才按照戈登的辦法，拿著一盒糖進(jìn)去收買人心。約翰和艾薩克剛鍘查出植物枯萎的原因，三艘奎爾戰(zhàn)艦就朝他們圍過(guò)來(lái)了。約翰提出了一個(gè)對(duì)付奎爾戰(zhàn)艦的辦法，加上亞飛特的配合，一切都執(zhí)行得很順利，可這時(shí)卻發(fā)現(xiàn)奎爾戰(zhàn)艦不見(jiàn)蹤影了，而約翰制造的量子泡泡將奧維爾號(hào)保持在一個(gè)二維空間外，讓大家看到了一副無(wú)比壯觀的美景。奧維爾號(hào)躲在二維空間以外，等奎爾人離開(kāi)，凱莉便趁這個(gè)機(jī)會(huì)，再去找艾德談話。艾德正說(shuō)到高潮之際，艾薩克發(fā)現(xiàn)二維空間能量正在衰竭，然后劇烈的震動(dòng)讓大家都被撞出了鼻血。等情況穩(wěn)定之后，艾德讓戈登將奧維爾號(hào)駛離此處，可沒(méi)想到這時(shí)二維異物關(guān)閉了，他們出不去。為了從二維空間離開(kāi)，約翰提議駕駛太空艙前去啟動(dòng)空間管，給奧維爾號(hào)開(kāi)路，而就在準(zhǔn)備的時(shí)候，科學(xué)組的成員都將此次失誤怪責(zé)在亞飛特的身上，被約翰狠狠罵了一頓，說(shuō)明這個(gè)決定是他下的，有錯(cuò)必須怪到他的頭上。約翰接連為危機(jī)想到辦法解決，證明了他的聰明才智，艾德這才問(wèn)約翰為何要隱瞞他的聰明才智。成功脫險(xiǎn)之后，艾德去向凱莉道歉，說(shuō)明是他小心眼了，不該懷疑自己的能力，并感謝凱莉的信任。